九州大学数理生物学研究室

メンバー紹介

野下 浩司(のした こうじ)

野下 浩司(のした こうじ)

所属:九州大学理学研究院生物科学部門数理生物学研究室

ウェブサイト

役職:助教

所属学会:日本古生物学会、日本進化学会、日本数理生物学会、日本生態学会、The Society for the Study of Evolution、日本育種学会、農業情報学会

連絡先:noshita[at]morphometrics.jp
※[at]を@に置き換えて下さい。

略歴

平成18(2006)年4月 – 平成22(2010)年3月 静岡大学 理学部 地球科学科
平成22(2010)年4月 – 平成27(2015)年3月 九州大学大学院 システム生命科学府
平成24(2012)年4月 – 平成27(2015)年3月 日本学術振興会特別研究員(DC1)
2014 年 4月 1日-2014 年 11月 30日 Visiting Scholar in Plotkin Research Group,UPenn (アメリカ)
平成27(2015)年4月 – 平成28(2016)年9月 東京大学 農学生命科学研究科 特任研究員
平成28(2016)年10月 – 令和2年(2020)年3月 科学技術振興機構 さきがけ専任研究員(「情報科学との協働による革新的な農産物栽培手法を実現するための技術基盤の創出」領域)
平成28(2016)年10月 – 現在 東京大学 農学生命科学研究科 農学共同研究員
2018年4月- 九州大学 理学研究院生物科学部門 数理生物学研究室 助教

研究内容

かたちを測ること(形態測定学)やモデル化し解析すること(理論形態学)に興味をもち研究に取り組んでいます.対象は動物(巻貝,マウス,ヒト),植物(ダイズ,コムギ,モモ),人工物(土器)など様々です.現在は特に,写真測量技術や3次元画像解析を用いて植物フェノタイピングの効率化を進める研究に重点的に取り組んでいます.生物や生物のつくる構造物のかたちの研究に興味ある方はお気軽にご連絡ください.

業績

査読論文

(10) Sakamoto, L., Kajiya-Kanegae, H., Noshita, K., Takanashi, H., Kobayashi, M., Kudo, T., Yano, K., Tokunaga, T., Tsutsumi, N., Iwata, H. (2019). Comparison of shape quantification methods for genomic prediction, and genome-wide association study of sorghum seed morphology. PLoS ONE, 14(11), e0224695. http://doi.org/10.1371/journal.pone.0224695
(9) Fukano, Y., Guo, W. Noshita, K., Hashida, H. and Kamikawa, S. Genotype-aggregated planting improves yield in Jerusalem artichoke (Helianthus tuberosus) due to self/non-self discrimination. (2018) Evolutionary Applications 12(3). pp. 508-518. https://doi.org/10.1111/eva.12735
(8) Guo, W. Zheng, B. Potgieter, A.B., Diot, J. Watanabe, K., Noshita, K., Jordan, D. Wang, X., Watson, J. Ninomiya, S. and Chapman, S.C. Aerial Imagery Analysis – Quantifying Appearance and Number of Sorghum Heads for Applications in Breeding and Agronomy. (2018) Frontiers in Plant Science 9, 1544. pp. 1–9. http://doi.org/10.3389/fpls.2018.01544
(7) Mu, Y., Fujii, Y., Takata, D., Zheng, B., Noshita, K., Honda, K., Ninomiya, S. and Guo W. Characterization of peach tree crown by using high-resolution images from an unmanned aerial vehicle. Horticulture Research (2018) 5 (74). pp. 1-10. http://doi.org/10.1038/s41438-018-0097-z
(6) Reynolds D.†, Baret F.†, Welcker C.†, Bostrom A.†, Ball J., Cellini F., Lorence A., Chawade A., Khafif M., Noshita K., Mueller-Linow M., Zhou J.*, Tardieu F.* What is cost-efficient phenotyping? Optimizing costs for different scenarios. Plant Science (2018) 282, pp. 14-22., (†Joint First Authours, *Corresponding Authors)http://doi.org/10.1016/j.plantsci.2018.06.015
(5) Shimizu, K., Kimoto, K., Noshita, K., Wakita, M., Fujiki, T., and Sasaki, T. Phylogeography of the pelagic snail Limacina helicina (Gastropoda: Thecosomata) in the subarctic western North Pacific, Journal of Molluscan Studies (2017), https://doi.org/10.1093/mollus/eyx040
(4) Fujiu, K., Shibata, M., Nakayama, Y., Ogata, F., Matsumoto, S., Noshita, K., Iwami, S., Nakae, S., Komuro, I., Nagai, R. and Manabe, I. A heart-brain-kidney network controls adaptation to cardiac stress through tissue macrophage activation. Nature Medicine (2017) 23 (5), pp. 611–622. http://doi.org/10.1038/nm.4326
(3) Noshita, K., Shimizu, K., and Sasaki, T. Geometric analysis and estimation of the growth rate gradient on gastropod shells. Journal of Theoretical Biology (2016), 389, pp. 11–19. http://doi.org/10.1016/j.jtbi.2015.10.011
(2) Noshita, K. Quantification and geometric analysis of coiling patterns in gastropod shells based on 3D and 2D image data. Journal of Theoretical Biology (2014) 363, pp. 93-104. http://doi.org/10.1016/j.jtbi.2014.08.010
(1) Noshita, K., Asami, T. and Ubukata, T. Functional constraints on coiling geometry and aperture inclination in gastropods. Paleobiology (2012) 39 (2), pp. 322–334. http://dx.doi.org/10.1666/10060.1

著書

(4) Kano, Y., Hon, J., Sulaiman, M. K., Aizu, M., Noshita, K., & Samejima, H. (2020). Stream Fish Biodiversity and the Effects of Plantations in the Bintulu Region, Sarawak. In N. Ishikawa & R. Soda (Eds.), Anthropogenic Tropical Forests: Human–Nature Interfaces on the Plantation Frontier pp. 235–274. Springer Singapore. ISBN: Print 978-981-13-7511-8, Online 978-981-13-7513-2. https://doi.org/10.1007/978-981-13-7513-2_13
(3) 野下 浩司 野外における作物個体・個体群3次元再構築. 新スマート農業 進化する農業情報利用 (農業情報学会 (編)) (2019) pp. 農林統計出版. ISBN: 978-4-89732-407-4
(2) Sasaki, T., Maekawa, Y., Takeda, Y., Atsushiba, M., Chen, C., Noshita, K., Uesugi, K. and Hoshino, M. 3D Visualization of Calcified and Non-calcified Molluscan Tissues Using Computed Tomography. Biomineralization (2018) pp. 83-93. Springer, Singapore. ISBN: Print 978-981-13-1001-0, Online 978-981-13-1002-7. https://doi.org/10.1007/978-981-13-1002-7_9
(1) 野下 浩司,田村 光平.幾何学的形態測定学とRを使った解析例.文化進化の考古学(中尾 央,松木 武彦,三中 信宏 編)(2017)pp. 179-218. 勁草書房.ISBN: 978-4-326-24845-2

日本語論文等

(10) 大倉 史生, 野下 浩司, 木下 俊則, 戸田 陽介. 深層学習の利活用による植物表現型解析技術の展望. 植物科学の最前線 (2019) 10, pp. 99-107. https://doi.org/10.24480/bsj-review.10b7.00160
(9) 内田 満夫, 野下 浩司, 小山 洋. VDT作業者の安全衛生評価におけるDeep Learningの活用. 産業衛生学雑誌 (2019) 61(6), pp. 256-260. https://doi.org/10.1539/sangyoeisei.2018-040-C
(8) 内田 満夫, 野下 浩司, 渡辺 由佳子, 小山 洋. 社会医学におけるAI研究. BIO Clinica (2019) 34 (3), pp. 89-93.
(7) 内田 満夫, 野下 浩司, 筒井 保博, 小山 洋. 産業保健におけるDeep Learningの活用:物流企業の職場巡視画像を用いたパイロット研究. 産業衛生学雑誌 (2018) 60 (6), pp. 191-195 https://doi.org/10.1539/sangyoeisei.2018-022-C
(6) 野下 浩司 野外における作物の3次元形態の再構築. アグリバイオ (2018) 2(3), pp. 14-19.
(5) 野下浩司 巻きの理論形態モデル:有殻軟体動物を例に. 日本数理生物学会ニュースレター (2017) 83, pp. 19-23.
(4) 矢部 志央理, 上原 奏子, 吉津 祐貴, 渡辺 翔, 野下 浩司. 育種学と農学のこれからを考える30 ~フェノタイピングは頭痛の種?~. 育種学研究 (2016) 18, pp. 67-71. http://doi.org/10.1270/jsbbr.18.67
(3) 野下浩司 フィラデルフィア滞在記. 日本数理生物学会ニュースレター (2016) 78, pp. 4-6.
(2) 野下浩司 腹足類殻形態への理論形学的アプローチ 日本数理生物学会ニュースレター (2012) 67, pp. 18-19.
(1) 野下浩司 巻貝殻形態の理論形態学的解析パッケージ:Spiral Shell Form. 静岡大学地球科学研究報告 (2010) 37, pp. 57–73.

現在・過去の競争的研究資金

[7] 九州大学 数理・データサイエンスに関する教育・研究支援プログラム,植物3次元形態データセットの作成と全体構造を記述する特徴量の開発,代表者:野下 浩司,2019.07-2020.03
[6] 日本学術振興会 新学術領域研究(研究領域提案型・出ユーラシア) ,三次元データベースと数理解析・モデル構築による分野統合的研究の促進,代表者:中尾 央(分担者:野下 浩司),2019.06.28-2024.03.31
[5] 日本学術振興会 科学研究費補助金(若手),作物3D形態ベンチマークデータセットの構築による植物フェノタイピング研究の加速,代表者:野下 浩司,2019.04-2021.03
[4] 日本学術振興会 科学研究費補助金(基盤研究(B)(特設分野研究)),Systems Bone Biology~骨・軟骨疾患の発症予測から疾患予防へ,代表者:篠原 正浩(分担者:野下 浩司),H30-H32
[3] 日本学術振興会 科学研究費補助金(基盤研究(B)),貝殻らせん成長メカニズムの解明:進化発生古生物学創成に向けて,代表者:遠藤 一佳(分担者:野下 浩司),H30-H34
[2] 科学技術振興機構 戦略的創造研究推進事業 さきがけ,マルチスケールデータ融合による草姿・草型の超解像フェノタイピング技術の開発,代表者:野下浩司,H28-H31
[1] 日本学術振興会 科学研究費補助金DC1(特別研究員奨励費), 形態の適応と形成過程の数理的研究,代表者:野下浩司,H24-H27

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