ゲノムインプリンティングの数理モデル
- 対立遺伝子多型の実現-
武田裕彦(九大・理・数理生物)
5月19 日 (火) 午後1時30分より
九大理学部3号館 6階 3631
数理生物学セミナー室
哺乳類におけるゲノムインプリンティングを調べるにあたり、数理モデルの枠組みの
上で、刷り込み多型が種間(Igf2r)、種内(WT1)などで観察される原因を明らかに
するために、流産のリスク、胎児間競争などの階層的な淘汰の総合を,可変な変数を
持つマルコフ遷移行列で表わし、パレト面に沿った離散力学系の技法によって遺伝子
刷込みの実現解を明らかにすることを考えます。統計力学の枠組みを用いて、世代数
>> 1 で起こる状況をアンサンブル平均、分散として評価します。エピジェネティッ
ク過程に関わる遺伝子群はネットワークを形成し、胚のvulnerabilityはその胎児の
発達過程に強くカップリングしている。このことから境界条件として、
[1]mitotic recombination (chromosome shuffling)
[2]accidental occurrence of deamination of 5-methyle C in CG islands
によってもたらされるLOHを評価することで、形態形成において細胞レベルで果たし
ている機能に応じて、Risk-Competitionを軸にプロットした相図のどの位置にその
遺伝子が落ちるかが決まります。