数理生物学演習 2012年度前期
お知らせ
- 最終レポートの提出期限は8月12日(日)です．
- プリントは特にありません．
- 次回は7月23日(月) 13時までに生物第２講義室に集合してください．
- 内容は「数理生物学でのプログラミング」です．
場所
生物第２講義室及び情報基盤センター講義室連絡先
野下 浩司Eメール: noshita at bio-math10.biology.kyushu-u.ac.jp
山口 諒
Eメール: ryamaguchi at bio-math10.biology.kyushu-u.ac.jp
入谷 亮介
Eメール: iritani at bio-math10.biology.kyushu-u.ac.jp
at を@に変えて送って下さい．
参考図書
リンク集
演習資料
- 2. 離散ロジスティックモデル
- 3. 指数増殖，ロジスティック成長
- 4. ロトカ・ボルテラ モデル
- 5. 突然変異固定までの待ち時間
- 6. Raupモデル; sageノートブックRaup, LV
- 7. データ解析の基礎; sageノートブックCLT
- 8. 疫学モデル; データ8-1, 8-3, 8-5
- 9. セル・オートマトン; sageノートブック CA, CGL
- 10. パターン形成; sageノートブック RD
- 11. 研究をはじめるために
- 12. 数理生物学は本当に役に立つのか; sageノートブックHNT
その他資料
内容（予定）
- Hello, World!：プログラミングの意義，プログラムが動くまで，環境導入
- 離散ロジスティックモデル：四則演算，繰り返し処理，ニュートン法，ファイル入出力，結果の出力
- 指数増殖，ロジスティック成長：条件分岐，オイラー法，数値計算と数式処理
- ロトカ・ボルテラ モデル：結果の可視化
- 突然変異固定までの待ち時間：確率過程，擬似乱数
- Raupモデル：3Dパラメータ表示
- データ解析の基礎：数値積分，関数
- 疫学モデル：最小二乗法
- セル・オートマトン：人工生命，時間変化する結果の可視化
- パターン形成：反応拡散系，空間パタン，２次元配列
- 研究をはじめるために: 文献検索，引用の仕方
- 数理生物学は本当に役に立つのか：応用例紹介
- 数理生物学でのプログラミング：研究の進め方